Project information
Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
- Project Identification
- NR8967
- Project Period
- 1/2006 - 12/2009
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Health of the CR
- Ministry of Agriculture R&D Programme
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Medicine
- prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.
- Mgr. Petra Pospíšilová, Ph.D.
- prof. MUDr. Jan Šmarda, DrSc.
- Cooperating Organization
-
St. Anne's University Hospital Brno
- Responsible person doc. MUDr. Vladana Woznicová, Ph.D.
- Responsible person Mgr. Monika Dvořáková Heroldová, Ph.D.
- Responsible person prof. MUDr. Miroslav Votava, CSc.
- Responsible person MUDr. Jana Račovská
Projekt předpokládá vyšetření desítek až set kmenů a izolátů pddruhu T. pallidum ssp. apllidum v hypervariabilních oblastech genomu. Rozdíly v těchto sekvencích budou použity pro identifikaci individuálních kmenů tohoto poddruhu.
Rozdíly v genomech kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum budou zjišťovány po PCR amplifikaci sekvenací PCR produktů. Bude navržen zjednodušený protokol na identifikaci nejčastějších kmenů na základě PCR aplifikace a RFLP.
Publications
Total number of publications: 90
2006
-
Diagnostika spirochety Treponema pallidum v biologických vzorcích pomocí PCR.
Year: 2006, type: Conference abstract
-
Identifikace a charakterizace sigma-54 závislých promotorů Treponema pallidum.
Year: 2006, type: Conference abstract
-
Komparativní genomika patogenních kmenů T. pallidum.
X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků., year: 2006
-
Komparativní genomika patogenních kmenů T. pallidum.
Year: 2006, type: Conference abstract
-
Komparativní genomová sekvenace (CGS) kmenů rodu Treponema.
Year: 2006, type: Conference abstract
-
Komparativní genomová sekvenace (CGS): nový typ sekvenování bakteriálních genomů.
X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků., year: 2006
-
Molekulárně-biologická diagnostika spirochety Treponema pallidum v biologickém materiálu.
X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků., year: 2006
-
Restrikční mapování blízce příbuzných spirochet rodu Treponema.
Year: 2006, type: Conference abstract
-
Sekvenace heterologních oblastí genomu T. pallidum sussp. pertenue kmene Samoan D: cesta ke kompletní genomové sekvenci původce yaws.
Year: 2006, type: Conference abstract
-
Studium promotorů Treponema pallidum: charakterizace promotorů pro faktor sigma-54.
X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků., year: 2006