Project information
Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
- Project Identification
- NR8967
- Project Period
- 1/2006 - 12/2009
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Health of the CR
- Ministry of Agriculture R&D Programme
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Medicine
- prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.
- Mgr. Petra Pospíšilová, Ph.D.
- prof. MUDr. Jan Šmarda, DrSc.
- Cooperating Organization
-
St. Anne's University Hospital Brno
- Responsible person doc. MUDr. Vladana Woznicová, Ph.D.
- Responsible person Mgr. Monika Dvořáková Heroldová, Ph.D.
- Responsible person prof. MUDr. Miroslav Votava, CSc.
- Responsible person MUDr. Jana Račovská
Projekt předpokládá vyšetření desítek až set kmenů a izolátů pddruhu T. pallidum ssp. apllidum v hypervariabilních oblastech genomu. Rozdíly v těchto sekvencích budou použity pro identifikaci individuálních kmenů tohoto poddruhu.
Rozdíly v genomech kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum budou zjišťovány po PCR amplifikaci sekvenací PCR produktů. Bude navržen zjednodušený protokol na identifikaci nejčastějších kmenů na základě PCR aplifikace a RFLP.
Publications
Total number of publications: 90
2007
-
Srovnání pyrosekvenování a komparativní genomové sekvenace u Treponema pallidum subsp. pertenue Samoa D.
24. Kongres Československé společnosti mikrobiologické. Abstrakty., year: 2007
-
Testování kandidátních lokusů pro typizaci klinických izolátů Treponema pallidum.
XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků., year: 2007
-
Určení kompletní genomové sekvence kmene Treponema pallidum subsp. pertenue CDC-2
Year: 2007, type: Conference abstract
-
Určení kompletní genomové sekvence kmene Treponema pallidum subspecies pertenue CDC-2
Year: 2007, type: Conference abstract
-
Určovanie genómovej sekvencie Treponema pallidum subspecies pallidum kmeňa Dallas 1
Year: 2007, type: Conference abstract
2006
-
Analýza sigma-54 závislých promotorů spirochety Treponema pallidum.
Year: 2006, type: Conference abstract
-
Comparison ot the syphilis and yaws spirochete genomes: comparative genome sequencing of T. pallidum ssp. pallidum Samoa D.
Year: 2006, type: Conference abstract
-
Detekce původce syfilis Treponema pallidum subsp. pallidum v klinických vzorcích.
Year: 2006, type: Conference abstract
-
Detekce Treponema pallidum subsp. pallidum v biologickém materiálu, výhledy pro epidemiologii syfilis
XXI. Pečenkovy epidemiologické dny., year: 2006
-
Diagnosis of syphilis by polymerase chain reaction and molecular typing of Treponema pallidum.
Reviews in Medical Microbiology, year: 2006, volume: 17, edition: 4