Project information
Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů

Information

This project doesn't include Faculty of Economics and Administration. It includes Faculty of Medicine. Official project website can be found on muni.cz.

Project Identification

NR8967

Project Period

1/2006 - 12/2009

Investor / Pogramme / Project type

Ministry of Health of the CR

Ministry of Agriculture R&D Programme

MU Faculty or unit

Faculty of Medicine

Cooperating Organization

St. Anne's University Hospital Brno

Responsible person doc. MUDr. Vladana Woznicová, Ph.D.
Responsible person Mgr. Monika Dvořáková Heroldová, Ph.D.
Responsible person prof. MUDr. Miroslav Votava, CSc.
Responsible person MUDr. Jana Račovská

Projekt předpokládá vyšetření desítek až set kmenů a izolátů pddruhu T. pallidum ssp. apllidum v hypervariabilních oblastech genomu. Rozdíly v těchto sekvencích budou použity pro identifikaci individuálních kmenů tohoto poddruhu.
Rozdíly v genomech kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum budou zjišťovány po PCR amplifikaci sekvenací PCR produktů. Bude navržen zjednodušený protokol na identifikaci nejčastějších kmenů na základě PCR aplifikace a RFLP.

Publications

Total number of publications: 90

2010

Najvirulentnější zástupca rodu Treponema - Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 a jeho celogenómová sekvencia.

MIKOLKA Pavol POSPÍŠILOVÁ Petra ŠMAJS David

Year: 2010, type:
Srovnání genomů původců yaws a syfilis.

ZOBANÍKOVÁ Marie ČEJKOVÁ Darina STROUHAL Michal POSPÍŠILOVÁ Petra WEINSTOCK G.M. ŠMAJS David

Conference abstract

Year: 2010, type: Conference abstract
Treponema pallidum: celogenomové rozdíly mezi poddruhy pallidum a pertenue.

ZOBANÍKOVÁ Marie ČEJKOVÁ Darina STROUHAL Michal POSPÍŠILOVÁ Petra WEINSTOCK G.M. ŠMAJS David

Conference abstract

Year: 2010, type: Conference abstract
Určení genomové sekvence Treponema pallidum subsp. pallidum kmene Mexico A pomocí metody Solexa.

PĚTROŠOVÁ Helena POSPÍŠILOVÁ Petra MIKALOVÁ Lenka ŠMAJS David

Conference abstract

Year: 2010, type: Conference abstract
Whole genome fingerprinting of 8 strains from the genus Treponema.

MIKALOVÁ Lenka STROUHAL Michal ČEJKOVÁ Darina ZOBANÍKOVÁ Marie POSPÍŠILOVÁ Petra NORRIS S. J. SODERGREN E. WEINSTOCK G. M.. ŠMAJS David

Conference abstract

Year: 2010, type: Conference abstract

2009

Celogenomové restrikční mapování u zástupců rodu Treponema.

MIKALOVÁ Lenka ŠMAJS David

Conference abstract

Year: 2009, type: Conference abstract
Detekce původce syfilis Treponema pallidum ssp. pallidum v klinickém materiálu pomocí nested PCR rekce.

FLASAROVÁ Magdalena MATĚJKOVÁ POSPÍŠILOVÁ Petra ŠMAJS David WOZNICOVÁ Vladana VALIŠOVÁ Zuzana

Conference abstract

Year: 2009, type: Conference abstract
Detekce Treponema pallidum subsp. pallidum v klinickém materiálu.

FLASAROVÁ Magdalena MATĚJKOVÁ POSPÍŠILOVÁ Petra VALIŠOVÁ Zuzana ŠMAJS David WOZNICOVÁ Vladana

Appeared in Conference without Proceedings

Year: 2009, type: Appeared in Conference without Proceedings
Diagnostika původce syfilis Treponema pallidum ssp. pallidum v klinickém materiálu pomocí nested PCR reakce.

FLASAROVÁ Magdalena MATĚJKOVÁ POSPÍŠILOVÁ Petra ŠMAJS David WOZNICOVÁ Vladana VALIŠOVÁ Zuzana

Conference abstract

Year: 2009, type: Conference abstract
Komparativní analýza genomů Treponema pallidum subspecies pertenue a Treponema pallidum subspecies pallidum.

ZOBANÍKOVÁ Marie MATĚJKOVÁ POSPÍŠILOVÁ Petra STROUHAL Michal ČEJKOVÁ Darina ŠMAJS David WEINSTOCK George M.

Conference abstract

Year: 2009, type: Conference abstract