Project information
Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
- Project Identification
- NR8967
- Project Period
- 1/2006 - 12/2009
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Health of the CR
- Ministry of Agriculture R&D Programme
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Medicine
- prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.
- Mgr. Petra Pospíšilová, Ph.D.
- prof. MUDr. Jan Šmarda, DrSc.
- Cooperating Organization
-
St. Anne's University Hospital Brno
- Responsible person doc. MUDr. Vladana Woznicová, Ph.D.
- Responsible person Mgr. Monika Dvořáková Heroldová, Ph.D.
- Responsible person prof. MUDr. Miroslav Votava, CSc.
- Responsible person MUDr. Jana Račovská
Projekt předpokládá vyšetření desítek až set kmenů a izolátů pddruhu T. pallidum ssp. apllidum v hypervariabilních oblastech genomu. Rozdíly v těchto sekvencích budou použity pro identifikaci individuálních kmenů tohoto poddruhu.
Rozdíly v genomech kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum budou zjišťovány po PCR amplifikaci sekvenací PCR produktů. Bude navržen zjednodušený protokol na identifikaci nejčastějších kmenů na základě PCR aplifikace a RFLP.
Publications
Total number of publications: 90
2007
-
Klinický materiál pro průkaz syfilis metodou polymerázové řetězové reakce.
Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie., year: 2007, volume: 56, edition: 2
-
Kompletní genomová sekvenace kmene Treponema pallidum subsp. pertenue Samoa D: srovnání pyrosekvencování a komparativní genomové sekvenace
Year: 2007, type: Conference abstract
-
Laboratorní diagnostika syfilis.
Year: 2007, type: R&D Presentation
-
PCR diagnostika a molekulární typizace původce syfilis: aktuální problémy PCR detekce.
Year: 2007, type: Conference abstract
-
Performance of CAPTIA SelectSyph-G enzyme-linked immunosorbent assay in syphilis testing of a high-risk population: analysis of discordant results.
Journal of Clinical Microbiology, year: 2007, volume: 45, edition: 6
-
Pilotní screening hypervariabilních lokusů v genomu Treponema pallidum u typových kmenů a klinických izolátů
24. Kongres Československé společnosti mikrobiologické. Abstrakty., year: 2007
-
Pyrosequencing as a tool for whole genome sequencing of Treponema pallidum subspecies.
Chemické Listy, year: 2007, volume: 101, edition: 5
-
Sekvenace genomů patogenních treponem: Sangerova sekvenace, komparativní genomová sekvenace a pyrosekvenace.
Year: 2007, type: Appeared in Conference without Proceedings
-
Sequencing of Treponema pallidum ssp. pertenue Samoa D genome.
In Abstract Book: 17th European Congress of Clinical Microbiology and Infectous Diseases. INTERNATIONAL JOURNAL OF ANTIMICROBIAL AGENTS., year: 2007
-
Srovnání komparativní genomové sekvenace a pyrosekvenace u Treponema pallidum subspecies pertenue Samoa D
Year: 2007, type: Conference abstract