C-13 Relaxation Study of RNA Dynamics: Application to UUCG Hairpin Loop

Varování

Publikace nespadá pod Ekonomicko-správní fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Studium dynamiky RNA pomocí relaxace C-13: Aplikace na smyčku UUCG
Autoři	KADEŘÁVEK Pavel FIALA Radovan
Rok publikování	2008
Druh	Článek ve sborníku
Konference	23rd NMR Valtice
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Obor	Biochemie
Klíčová slova	dynamics; NMR spectroscopy; nucleic acid; relaxation; chemical shift anisotropy
Popis	Metoda model-free, která se používá ke studiu dynamiky molekul na základě NMR relaxace byla rozšířena o explicitní zahrnutí vlivu asymetrického charakteru tenzoru chemického stínění uhlíku C-13. Výsledky poskytované vylepšenou metodou byly studovány na tetradekameru RNA obsahující smyčku UUCG. Relaxační parametry byly měřeny pro všechny protonované atomy uhlíku v bázích a uhlíku C1’ při 600 MHz a 500 MHz. Výsledky dosažené s pomocí rozšířené metody model-free jsou porovnávány s výsledky získanými standardním postupem a rovněž s publikovanými daty.
Související projekty:	Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím Biomolekulární centrum