Proteiny AtTRB patří do skupiny SMH proteinů, které jsou definovány přítomností Myb domény na svém N-konci, centrální H1/5 doménou a C-koncovou coiled-coil doménou. Proteiny typu SMH jsou specifické pouze pro rostlinnou říši a jejich členové se váží Myb doménou typu telobox nejen na rostlinné telomerické repetice, ale také mohou mít regulační funkci v promotorech jiných genů. Do současné doby byly v naší laboratoři charakterizovány tři proteiny z této skupiny. Ačkoliv byla u všech proteinů prokázána specifická vazba na ds-telomerické repetice a u některých také na G-bohaté vlákno telomerické repetice, v dvojhybridním systému se jednotlivé proteiny významně liší svými interakčními partnery. Cílem tohoto projektu je vyhledat interakční partnery přímo v rostlinném systému pomocí metody TAP-tag, která umožňuje šetrnou dvojkrokovou purifikaci proteinů. Projekt by měl také s použitím ChIP analýzy pomoci vyřešit otázku, zda jsou AtTRB proteiny lokalizovány na telomerách a nebo rozeznávají intersticiální

Publikace