Informace o projektu
Biomolekulární centrum
- Kód projektu
- LC06030
- Období řešení
- 3/2006 - 12/2011
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Centra základního výzkumu
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Středoevropský technologický institut
- prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc.
- Klíčová slova
- léčiva proti rakovině, biosenzory, lektiny, počítačové modelování biomolekul, biomolekulární NMR
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
- Odpovědná osoba doc. RNDr. Ivan Rychlík, Ph.D.
Klíčovým motivem projektu je posunout strukturní biologii v ČR z úrovně studia jednotlivých biomakromolekul na úroveň studia jejich komplexů. To bude uskutečněno jednak implementací nejmodernějších trendů ve vybraných metodách v této oblasti (NMR spektroskopie, počítačové modelování), jednak orientací na problémy, které stojí v popředí zájmu současných věd o živých systémech. K nim patří studium klíčových buněčných procesů jako je udržení stability genomu a oprava DNA, syntéza bílkovin v ribosomu či přenos informace prostřednictvím rozpoznávání (lektiny). Vybrané směry výzkumu budou dovedeny do bioanalytických (biosensory) či biomedicinálních (vakcíny, chemoterapeutika) závěrů vhodných jako východiska pro aplikovaný výzkum a vývoj. Dosažení cíle projektu není možné pouze v jediné ze zakládajících organizací Centra, je třeba spolupráce všech partnerů. U řady jednotlivých dílčích cílů bude vyžadována i spolupráce zahraniční.
Výsledky
Klíčovým motivem projektu je posunout strukturní biologii v ČR z úrovně studia jednotlivých biomakromolekul na úroveň studia jejich komplexů. To bude uskutečněno jednak implementací nejmodernějších trendů ve vybraných metodách v této oblasti (NMR spektroskopie, počítačové modelování), jednak orientací na problémy, které stojí v popředí zájmu současných věd o živých systémech. K nim patří studium klíčových buněčných procesů jako je udržení stability genomu a oprava DNA, syntéza bílkovin v ribosomu či přenos informace prostřednictvím rozpoznávání (lektiny). Vybrané směry výzkumu budou dovedeny do bioanalytických (biosensory) či biomedicinálních (vakcíny, chemoterapeutika) závěrů vhodných jako východiska pro aplikovaný výzkum a vývoj. Dosažení cíle projektu není možné pouze v jediné ze zakládajících organizací Centra, je třeba spolupráce všech partnerů. U řady jednotlivých dílčích cílů bude vyžadována i spolupráce zahraniční.
Publikace
Počet publikací: 284
2008
-
TRITON: a graphical tool for ligand-binding protein engineering
Bioinformatics, rok: 2008, ročník: 24, vydání: 17
-
Ups and Downs of Homologous Recombination and Repair of DNA Double-Strand Breaks
Rok: 2008, druh: Prezentace v oblasti VaV (AV tvorba, WEB aplikace apod.)
-
Web server to identify similarity of amino acid motifs to compounds (SAAMCO)
Journal of Chemical Information and Modeling, rok: 2008, ročník: 48, vydání: 7
-
www.rnaworkbench.com: A new program for analyzing RNA interference
Computer Methods and Programs in Biomedicine, rok: 2008, ročník: 90, vydání: 1
2007
-
13C detected NMR experiments for measuring chemical shifts and coupling constants in nucleic acid bases
Journal of Biomolecular NMR, rok: 2007, ročník: 39, vydání: 4
-
13C-detected NMR experiments for measuring scalar and dipolar coupling in RNA
Viral RNA: Structure, Function and Targeting, rok: 2007
-
15N NMR Spectroscopy in Structural Analysis: An Update (2001-2005)
Current Organic Chemistry, rok: 2007, ročník: 11, vydání: 13, DOI
-
1H, 13C and 15N NMR coordination shifts in gold(III), cobalt(III), rhodium(III) chloride complexes with pyridine, 2,2'-bipyridine and 1,10-phenantroline
Magnetic Resonance in Chemistry, rok: 2007, ročník: 45, vydání: 1, DOI
-
3. Structural and thermodynamical characterization of BclA, a lectin from Burkholderia cepacia complex (BCC)
14th European Carbohydrate Symposium, EUROCARB 14, rok: 2007
-
Acetylcholinesterases - the similarities and differences
Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry, rok: 2007, ročník: 22, vydání: 4