Informace o projektu
Biomolekulární centrum
- Kód projektu
- LC06030
- Období řešení
- 3/2006 - 12/2011
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Centra základního výzkumu
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Středoevropský technologický institut
- prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc.
- Klíčová slova
- léčiva proti rakovině, biosenzory, lektiny, počítačové modelování biomolekul, biomolekulární NMR
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
- Odpovědná osoba doc. RNDr. Ivan Rychlík, Ph.D.
Klíčovým motivem projektu je posunout strukturní biologii v ČR z úrovně studia jednotlivých biomakromolekul na úroveň studia jejich komplexů. To bude uskutečněno jednak implementací nejmodernějších trendů ve vybraných metodách v této oblasti (NMR spektroskopie, počítačové modelování), jednak orientací na problémy, které stojí v popředí zájmu současných věd o živých systémech. K nim patří studium klíčových buněčných procesů jako je udržení stability genomu a oprava DNA, syntéza bílkovin v ribosomu či přenos informace prostřednictvím rozpoznávání (lektiny). Vybrané směry výzkumu budou dovedeny do bioanalytických (biosensory) či biomedicinálních (vakcíny, chemoterapeutika) závěrů vhodných jako východiska pro aplikovaný výzkum a vývoj. Dosažení cíle projektu není možné pouze v jediné ze zakládajících organizací Centra, je třeba spolupráce všech partnerů. U řady jednotlivých dílčích cílů bude vyžadována i spolupráce zahraniční.
Výsledky
Klíčovým motivem projektu je posunout strukturní biologii v ČR z úrovně studia jednotlivých biomakromolekul na úroveň studia jejich komplexů. To bude uskutečněno jednak implementací nejmodernějších trendů ve vybraných metodách v této oblasti (NMR spektroskopie, počítačové modelování), jednak orientací na problémy, které stojí v popředí zájmu současných věd o živých systémech. K nim patří studium klíčových buněčných procesů jako je udržení stability genomu a oprava DNA, syntéza bílkovin v ribosomu či přenos informace prostřednictvím rozpoznávání (lektiny). Vybrané směry výzkumu budou dovedeny do bioanalytických (biosensory) či biomedicinálních (vakcíny, chemoterapeutika) závěrů vhodných jako východiska pro aplikovaný výzkum a vývoj. Dosažení cíle projektu není možné pouze v jediné ze zakládajících organizací Centra, je třeba spolupráce všech partnerů. U řady jednotlivých dílčích cílů bude vyžadována i spolupráce zahraniční.
Publikace
Počet publikací: 284
2008
-
Rad54 stimulation of Mus81/Mms4 endonuclease
Rok: 2008, druh: Prezentace v oblasti VaV (AV tvorba, WEB aplikace apod.)
-
Regulatory Phosphorylations of Cyclin-Dependent Kinase 2: An Insight from the Molecular Dynamics Simulations
Journal of Molecular Modeling, rok: 2008, ročník: 14, vydání: 8
-
Size, shape and surface morphology of starch granules from Norway spruce needles revealed by transmission electron microscopy and atomic force microscopy: effects of elevated CO2 concentration
Tree Physiology, rok: 2008, ročník: 28, vydání: 10
-
Software news and updates: Electronegativity equalization method: Parameterization and validation for organic molecules using the Merz-Kollman-Singh charge distribution scheme
Journal of Computational Chemistry, rok: 2008, ročník: 2009, vydání: 30
-
Stimulation of Mus81-Mms4 activity by Rad54
Rok: 2008, druh: Prezentace v oblasti VaV (AV tvorba, WEB aplikace apod.)
-
Structural and solvent effects on the 13C and 15N NMR chemical shifts of indoloquinoline alkaloids: experimental and DFT study
Magnetic Resonance in Chemistry, rok: 2008, ročník: 46, vydání: 1, DOI
-
Structural basis for mannose recognition by a lectin from opportunistic bacteria Burkholderia cenocepacia
Biochemical Journal, rok: 2008, ročník: 411, vydání: 2
-
Synthesis and structure_activity relationship studies of theophylline analogs
Bioorganic & Medicinal Chemistry, rok: 2008, ročník: 16, vydání: 17
-
Tautomeric Equilibrium, Stability, and Hydrogen Bonding in 2-Deoxyguanosine Monophosphate Complexed with Mg2+
JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B, rok: 2008, ročník: 112, vydání: 1
-
Theoretical Study on the Factors Controlling the Stability of the Borate Complexes of Ribose, Arabinose, Lyxose, and Xylose
Chemistry – A European Journal, rok: 2008, ročník: 32/2008, vydání: 14