Informace o projektu
Nové možnosti diagnostiky leukémie s využitím technologie DNA-mikročipů
- Kód projektu
- 1A8241
- Období řešení
- 7/2004 - 12/2006
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Zdraví obyvatel (Národní program výzkumu)
- Fakulta / Pracoviště MU
- Fakulta informatiky
- Klíčová slova
- DNA microarrays;histone modifications;inhibitors of deacetylases;chromatin structure;leukemia;histon
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba doc. RNDr. Stanislav Kozubek, DrSc.
- Odpovědná osoba prof. MUDr. Jiří Mayer, CSc.
Bude studována exprese pomocí DNA microarrays u leukémií, vhodných kontrolních buněk a pro in vitro populace. Změny budou korelovány s epigenetickými charakteristikami chromatinu na úrovni jeho modifikací (metylace, acetylace histonů, metylace DNA). Strukturální charakteristiky chromatinu budou zkoumány v místech se změnami exprese pomocí fluorescenční in situ hybridizace, spektrální mikroskopie a imunoFISH. Budou testovány protinádorové látky s úzkým spektrem účinku na úrovni exprese. Využitím pokročilých metod vizualizace jaderných stuktur a moderní konfokální mikroskopie bude studován mechanismus vzniku a progrese leukémií. Cílem bude navrhnout vhodné markry pro diagnostiku. Domníváme se, že studium genů měnících expresi a epigenetických mechanismů stojících za těmito změnami nám umožní navrhnout cílové molekuly pro léčbu.
Publikace
Počet publikací: 19
2005
-
New practical tools for microarray data analysis
Rok: 2005, druh: Konferenční abstrakty
-
Normalizační metody ve zpracování dat z DNA Microarrays
Rok: 2005, druh: Konferenční abstrakty
-
Nuclear levels and patterns of histone H3 modification and HP1 proteins after inhibition of histone deacetylases
Journal of Cell Science, rok: 2005, ročník: 118, vydání: 21
-
Sledování změn genové exprese u pacientů s kolorektálním karcinomem pomocí cDNA microarrays technologie a jejich diagnostika pomocí transkripčních map
Rok: 2005, druh: Konferenční abstrakty
-
Transcriptional profiling of human CD34+ cells during in vitro differentiation
Rok: 2005, druh: Konferenční abstrakty
2004
-
Clustering of genes with similar regulation patterns during monocyte and granulocyte differentiation of HL-60 cells
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Cytological study of DNA methylation and histone methylation patterns in human cell lines
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
Dynamics of HP1 transgene loci movement and silencing in living cells
Biophysics of the Genome, rok: 2004
-
From Jenalumar to Ultrafast Microscopy of Living Cells
Biophysics of the Genome, rok: 2004