Effects of Restrained Sampling Space and Nonplanar Amino Groups on Free-Energy Predictions for RNA with Imino and Sheared Tandem GA Base Pairs Flanked by GC, CG, iGiC or iCIG Base Pairs

Varování

Publikace nespadá pod Ekonomicko-správní fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Efekt omezeného sámplování a neplanárních aminoskupin na volnou energii predikcí pro RNA s imino a (sheared) hromadnými páry bází GA obklopenými páry GC, CG, iGiC nebo iCiG.
Autoři	YILDIRIM Ilyas STERN Harry ŠPONER Jiří ŠPAČKOVÁ Naděžda TURNER Douglas
Rok publikování	2009
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Journal of Chemical Theory and Computation
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Obor	Biofyzika
Klíčová slova	base pairs; NMR; amber force field
Popis	Guanino adeninové páry bází hrají důležitou roli při určení struktury, dynamiky a stability RNA. Předložené výpočty testují přístup termodynamické interagrace se silovým polem amber99 srovnáním vypočtených předpovědí rozdílů volných energií s rozdíly volných energií očekávaných na základě struktur RNA motivů určených pomocí NMR.
Související projekty:	Biomolekulární centrum