Identifikace genů rezistence k padlí travnímu u planého ječmene Hordeum vulgare ssp. spontaneum PI391126
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2009 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | XIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Genetika a molekulární biologie |
| Klíčová slova | mapping; SSR; powdery mildew; Blumeria graminis |
| Popis | Cílem práce bylo využití planého ječmene PI391126 získaného z genové banky USDA k identifikaci účinných genů odolnosti k padlí travnímu. S tímto cílem bylo provedeno křížení náchylné odrůdy Tiffany s PI391126, získaná generace F1 byla zdrojem pro analyzovanou populaci F2. Pro zjištění počtu genů rezistence a typu dědičnosti byly testované rostliny parentální, F1 a F2 generace inokulovány virulentním patotypem (Va7) 4523. Reakční typy (RT) rostlin byly odečítány podle devítibodové stupnice 0-4, včetně intertypů. V populaci generace F2 bylo zjištěno 234 odolných a 6 náchylných rostlin. Testem chí-kvadrát (1,37) byl potvrzen štěpný poměr 63:1 a byla tak stanovena přítomnost tří genů odolnosti s dominantní dědičností. Fenotypové hodnocení generace F1 ukázalo na neúplně dominantní dědičnost. K identifikaci genů bylo využito genetické mapování v populaci F2, kterou tvořilo celkem 124 rostlin. Jako DNA markery byly použity mikrosatelity (SSR - Simple Sequence Repeat). Dále byly navrženy primery (program Primer3) pro nové markery odvozené ze sekvence genu RGH1a (Resistance Gene Homologue 1a; databáze NCBI) z lokusu Mla. Vazba mezi markery a geny odolnosti byla identifikována pomocí dvou bulků rostlin, a to 19 odolných (RT 0) a 18 náchylných (RT 3-4 a 4) rostlin generace F2. Pomocí nich byla zjištěna genetická vazba s markery GBM1007, Bmac0213, UMB503 a RGH1aE2a na chromozomu 1H, GBMS247, Bmac0134, GBM1281, GBM1121 a Bmag0692 na chromozomu 2H a Bmag0225 na chromozomu 3H. Marker RGH1aE2a a Bmag0225 nevykazovali na rozdíl od ostatních kodominantní charakter. Mapováním pomocí všech rostlin F2 byla potvrzena statisticky významná vazba u GBM1007 (LOD = 5,15) na chromozomu 1H a u Bmac0134 (LOD = 2,8) na chromozomu 2H. Pro třetí gen nebyla prozatím potvrzena statisticky významná vazba s žádným DNA markerem. |
| Související projekty: |