Generation of Digital Phantoms of Cell Nuclei and Simulation of Image Formation in 3D Image Cytometry

Varování

Publikace nespadá pod Ekonomicko-správní fakultu, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Generování digitálních fantomů buněčných jader a simulace tvorby obrazu v 3D obrazové cytometrii
Autoři	SVOBODA David KOZUBEK Michal STEJSKAL Stanislav
Rok publikování	2009
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Cytometry Part A
Fakulta / Pracoviště MU	Fakulta informatiky
Citace
Doi	http://dx.doi.org/10.1002/cyto.a.20714
Obor	Využití počítačů, robotika a její aplikace
Klíčová slova	digital phantom; synthetic image; procedural texture; point spread function; fluorescence optical microscope; 3D image cytometry
Popis	V obrazové cytometrii se denně setkáváme s problémem kvality snímků buněk a zejména s problémem kvality analyzačních metod. Jedním ze způsobů měření kvality těchto metod je využití tzv. fantomů. V tomto článku je popsán postup, jakým způsobem vygenerovat digiální fantomy pro specifické druhy biomedicínských dat. Dále se zde také popsána simulace průchodu obrazu takového fantomu optickou soustavou a simulace snímání. Celkově je zde definován popis, jakým způsobem je možné generovat umělá obrazová data. Součástí textu je také měření kvality takto vygenerovaných dat a jejich srovnání s původními realnými obrazovými daty.
Související projekty:	Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů