Identifikace a typizace bakterií systémem RiboPrinter.
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2008 |
| Druh | Vyžádané přednášky |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Popis | Ribotypizace je druhově až kmenově specifická molekulárně-biologická metoda využívaná v taxonomii bakterií. Je založená na selektivní hybridizaci a následné detekci restrikčních fragmentů nesoucích geny pro ribozomální RNA. Ribotypizace byla popsána a poprvé použita pro identifikaci bakterií v roce 1986 (Grimont a Grimont, 1986, Ann. Inst. Pasteur/Microbiol., 137B: 165-175) a v následujících letech byla aplikována pro typizaci různých bakteriálních skupin. Její provedení - tzv. manuální ribotypizace - je však časově i instrumentálně náročný proces, často s nízkou mezilaboratorní reprodukovatelností výsledků. Automatizace ribotypizace byla umožněna komerčním systémem RiboPrinter Microbial Identification System (DuPont Qualicon, USA), který významně urychluje celý proces ribotypizace a poskytuje vysoce standardní výsledky. RiboPrinter umožňuje jednak charakterizaci kmene (to je stanovení ribotypu) a díky dodávané databázi ribotypů, obsahující 6448 ribotypů referenčních bakteriálních kmenů, také eventuální identifikaci neznámého izolátu. V rámci této přednášky budou popsány základní principy, postup provedení a výhody i nevýhody manuální a automatické ribotypizace. Jako příklad využití systému RiboPrinter budou prezentovány výsledky automatické ribotypizace zástupců druhu Streptococcus mutans z humánního klinického materiálu. Podpořeno projekty MSM0021622416 a 1M0528. |
| Související projekty: |