Molecular characteristics of Bifidobacterium strains collected in the Czech Collection of Microorganisms (CCM) and Laktoflora(CCDM) and reclassification of Bifidobacterium adolescentis CCM 3761 as Bifidobacterium pseudocatenulatum

Varování

Publikace nespadá pod Ekonomicko-správní fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Název česky Molekulární charakterizace kmenů Bifidobacterium uložených ve České sbírce mikroorganismů (CCM) a Laktoflora (CCDM) a reklasifikace Bifidobacterium adolescentis CCM 3761 na Bifidobacterium pseudocatenulatum
Autoři

RITTICH Bohuslav ŠPANOVÁ Alena BURDYCHOVÁ Radka KŘÍŽOVÁ Jana DRÁB Vladimír DRBOHLAV Jan

Rok publikování 2007
Druh Článek ve sborníku
Konference 2nd Symposium on Propionibacteria and Bifidobacteria
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
Obor Genetika a molekulární biologie
Klíčová slova Bifidobacterium; identification; PCR; ARDRA; rep-PCR
Popis Šestnáct kmenů jedenácti druhů bakterií Bifidobacterium bylo použito k ověření testovaných metod. Kmeny byly získány České sbírky mikroorganismů (CCM, Brno) a Laktoflora (CCDM, Tábor). DNA byla amplifikována pomocí dvou rozdílných rodově specifických primerů z oblasti 16S rDNA. Pro restrikční analýzu byly použity amplikony dlouhé 914 a 523 bp. Byly pouzity restriktasy BamHI, Sau3AI, TaqI, Sau96I, AluI a NciI. Pro RAPD a rep-PCR bylo použito sedm náhodných primerů, případně primery BOXA1R a (GTG)5. bylo zjištěno, že zařazení kmene B. adolescentis CCM 3761 neodpovídá jeho taxonomické pozici a kmen byl reklasifikován jako B. pseudocatenulatum. Pro potvrzení identifikace kmenů byly sekvenovány amplikony oblasti 16S rDNA u kmenů B. adolescentis CCM 3761, B. catenulatum DSM 16992T, B. pseudocatenulatum CCM 7094T a B. adolescentis CCM 4987T.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.