Molecular characteristics of Bifidobacterium strains collected in the Czech Collection of Microorganisms (CCM) and Laktoflora(CCDM) and reclassification of Bifidobacterium adolescentis CCM 3761 as Bifidobacterium pseudocatenulatum
| Název česky | Molekulární charakterizace kmenů Bifidobacterium uložených ve České sbírce mikroorganismů (CCM) a Laktoflora (CCDM) a reklasifikace Bifidobacterium adolescentis CCM 3761 na Bifidobacterium pseudocatenulatum |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2007 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | 2nd Symposium on Propionibacteria and Bifidobacteria |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Genetika a molekulární biologie |
| Klíčová slova | Bifidobacterium; identification; PCR; ARDRA; rep-PCR |
| Popis | Šestnáct kmenů jedenácti druhů bakterií Bifidobacterium bylo použito k ověření testovaných metod. Kmeny byly získány České sbírky mikroorganismů (CCM, Brno) a Laktoflora (CCDM, Tábor). DNA byla amplifikována pomocí dvou rozdílných rodově specifických primerů z oblasti 16S rDNA. Pro restrikční analýzu byly použity amplikony dlouhé 914 a 523 bp. Byly pouzity restriktasy BamHI, Sau3AI, TaqI, Sau96I, AluI a NciI. Pro RAPD a rep-PCR bylo použito sedm náhodných primerů, případně primery BOXA1R a (GTG)5. bylo zjištěno, že zařazení kmene B. adolescentis CCM 3761 neodpovídá jeho taxonomické pozici a kmen byl reklasifikován jako B. pseudocatenulatum. Pro potvrzení identifikace kmenů byly sekvenovány amplikony oblasti 16S rDNA u kmenů B. adolescentis CCM 3761, B. catenulatum DSM 16992T, B. pseudocatenulatum CCM 7094T a B. adolescentis CCM 4987T. |
| Související projekty: |