Možnosti komparativní genomové hybridizace s vyšším rozlišením (HR-CGH) a array-CGH při detekci prognostických markerů u neuroblastomu

Varování

Publikace nespadá pod Ekonomicko-správní fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

KUGLÍK Petr VRANOVÁ Vladimíra NEČESALOVÁ Eva ŽEŽULKOVÁ Dita ŠTEFANČÍKOVÁ Lenka FILKOVÁ Hana MAZÁNEK Pavel ŠTĚRBA Jaroslav VESELSKÁ Renata

Rok publikování 2006
Druh Článek ve sborníku
Konference II. dny diagnostické, prediktivní a experimentální onkologie
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
Obor Genetika a molekulární biologie
Klíčová slova Neuroblastoma; chromosomal aberrations; high resolution comparative genomic hybridization; array-CGH; GenoSenzor
Popis Neuroblastom je pevný dětský tumor periferního nervového systému. Patří mezi nejčastější dětské solidní tumory, představuje přibližně 7 až 10 % všech pediatrických nádorových onemocnění a je příčinou asi 15 % úmrtí na nádorová onemocnění v dětství. Neuroblastom je charakteristický svou výraznou genetickou rozmanitostí, která způsobuje jeho různorodé klinické chování. Tyto genetické změny jsou typické pro jednotlivá stádia onemocnění a jejich stanovení je využíváno k odhalování biologických vlastností nádoru a pro racionální volbu individuální terapie. Ke stratifikaci jednotlivých pacientů do rizikových podskupin (vysoké-HR, střední-IMR, nízké-LR) jsou v klinické praxi doposud užívána následující kriteria: klinické stadium (INSS), věk v době diagnózy, N-myc amplifikace, histologie (tzv. Shimadova klasifikace) a DNA index. V současnosti však do běžné klinické praxe začínají pronikat i další molekulárně biologické a cytogenetické markery ovlivňující stratifikaci pacientů s neuroblastomem. Mezi prognostické znaky, které jsou součástí nové léčebné strategie COG (Childrens Oncology Group) patří nově i průkaz del 1p a LOH 11q, přidatné informace o biologických vlastnostech nádoru však mohou poskytnout i změny na chromozomech 3p či 17q. Mezi další příznivé biologické vlastnosti nádoru patří i hyperdiploidní karyotyp, minimum strukturálních změn chromozomů, zatímco diploidní karyotyp či četné strukturální změny chromozomů charakterizují nádory s nepříznivými biologickými vlastnostmi. K identifikaci doposud známých prognosticky významných cytogenetických znaků u neuroblastomu jsou dnes vedle klasické cytogenetiky a interfázní fluorescenční hybridizace (I-FISH) používány zejména metody celogenomového screeningu založené na technikách komparativní genomové hybridizace (CGH) či komparativní genomové hybridizace s vyšším rozlišením (HR-CGH). Rezoluční limit těchto technik dosahuje 3 až 5 Mb. V poslední době se stále více prosazují techniky genetické profilace jednotlivých subtypů neuroblastomu pomocí technologie array-CGH, Tento přístup umožňuje určování změn počtu kopií mnoha genů zapojených do procesu tumorigeneze a představuje metodu k s velkým potenciálem pro stanovování genetických markerů neuroblastomu. V letech 1998-2006 bylo v Laboratoři molekulární cytogenetiky OLG FN Brno ve spolupráci s Klinikou dětské onkologie FN Brno provedeno molekulárně cytogenetické vyšetření primární nádorové tkáně celkem u 50 dětí s neuroblastomem. K identifikaci prognosticky významných cytogenetických znaků byly používány nejprve techniky interfázní fluorescenční hybridizace (I-FISH), od roku 2001 jsou též používány metody komparativní genomová hybridizace (CGH) a komparativní genomová hybridizace s vysokým rozlišením (HR-CGH). V roce 2006 jsme provedli první vyšetření pacientů s neuroblastomem pomocí technologie array-CGH (GenoSenzor Array 300). Naše práce shrnuje cytogenetické nálezy u pacientů ve vztahu ke klinickým údajům a dokumentuje přinos jednotlivých metod k detekci prognosticky významných cytogenetických znaků u neuroblastomu.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.