NMR experiments for detection of quaternary carbons in nucleic acid bases.
| Název česky | NMR experimenty pro detekci kvarterních uhlíků v bazích nukleových kyselin |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2006 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | 8th Central European NMR Symposium |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Fyzikální chemie a teoretická chemie |
| Klíčová slova | NMR; biological macromolecules; nucleic acids |
| Popis | Nízká protonová hustota v nukleových kyselinách je problémem při strukturní charakterizaci s použitím dat NMR. Pouze 6 rozlišitelných protonů v ribóze RNA a jen jeden nebo dva nevyměnitelné protony v purinových nebo pyrimidinových bazích produkují pouze omezený počet konformačně závislých NOE interakcí. Pro charakterizaci struktury nukleových kyselin s dobrou správností je vysoce důležité doplnit NOE data dalšími informacemi. Protonové chemické posuny jsou k dispozici z přiřazených 1H-13C a 1H-15N jednovazebných korelačních spekter. Rovněž chemiké posuny glykosidických dusíků mohou být získány z 2D a 3D experimentů korelujících cukerné H1 a bázové H6/H8 protony. Dosud byla ale věnována jen malá pozornost studiím kvarterních uhlíků v bazích nukleových kyslin. Potenciálně, jejich chemické posuny, odrážející sekundární a terciárné strukturu, mohou být aplikovány jako cené vstupní informace při strukturních výpočtech. Protože počet kvarterních uhlíků převyšuje počet uhlíků s přímo vázaným protonem, je nezbytné vyvinout strategie jejich detekce. V příspěvku jsou prezenrovány nové experimenty, založené jak na nepřímé korelaci se vzdálenými protony, tak i přímé detekci C-13 jader budou prezentovány. |
| Související projekty: |