Biotypizace a ribotypizace kmenů Aeromonas hydrophila komplexu
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2005 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | I. diskusné fórum klinickej mikrobiológie |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Mikrobiologie, virologie |
| Klíčová slova | Biotyping; Ribotyping; Identification; Aeromonas |
| Popis | Aeromonády patří mezi gramnegativní fermentující oxidáza pozitivní bakterie, které se vyskytují běžně ve vodních ekosystémech tropů, subtropů i mírného pásma. Tyto vodou přenosné organismy mohou však u hostitele způsobovat také gastroenteritidy, ale také ranné infekce či vzácně závažné septické stavy. Nejčastějšími patogenními aeromonádami člověka jsou A. hydrophila subsp. hydrophila, A. caviae a A. sobria. Ve vodním prostředí se pak kromě zmiňovaných vyskytují A. bestiarum. A. salmonicida, A. media a další. Biochemické vlastnosti skupiny 15 kmenů získaných z klinického materiálu a z vodního prostředí byly testovány komerční soupravou ENTEROtest24 (Pliva-Lachema) a dodatkovými testy. Charakterizace kmenů byla rozšířena ribotypizací izolátů a referenčních kmenů provedenou pomocí EcoRI restrikčního enzymu a značené sondy komplementární k 16S a 23S rRNA. Pomocí biotypizace byly všechny testované kmeny identifikovány jako zástupci A. hydrophila komplexu. Izoláty se shodovaly ve všech testech klíčových pro A. hydrophila komplex a to bez ohledu na zdroj izolátů. Ribotypizace umožnila zařazení všech klinických izolátů až do poddruhu A. hydrophila subsp. hydrophila. Vodní izoláty náleží do samostatné, od ostatních kmenů dobře oddělené skupiny. Jeden kmen této skupiny vykazuje velkou podobnost ribotypu s typovou kulturou A. bestiarum, zatímco ostatní kmeny nebylo možné na základě podobnosti ribotypů klasifikovat. Z výsledků vyplývá, že ačkoliv byly všechny kmeny na základě shodných biochemických vlastností zařazeny do A. hydrophila komplexu, ribotypizace odhalila zásadní rozdíly v profilu ribotypů izolátů z klinického materiálu a z vodního prostředí. Testované izoláty z vod pravděpodobně představují nový taxon s výjimkou jednoho A. bestiarum kmene. Ribotypizace narozdíl od biotypizace klasifikovala klinické izoláty až do poddruhu a jeví se být vhodnou metodou pro studium aeromonád. Přestože je práce založená na malé skupině kmenů potvrzuje se, že A. hydrophila subsp. hydrophila je jedním z nejčetněji zastoupených druhů aeromonád v klinickém materiálu a že vodní ekosystém je v zastoupení aeromonád druhově rozmanitější. |
| Související projekty: |