Komparativní genomika patogenních poddruhů treponema pallidum

Varování

Publikace nespadá pod Ekonomicko-správní fakultu, ale pod Lékařskou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

MATĚJKOVÁ Petra ŠMAJS David NORRIS SJ WEINSTOCK GM

Rok publikování 2003
Druh Článek ve sborníku
Konference Sborník abstraktů XII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2003
Fakulta / Pracoviště MU

Lékařská fakulta

Citace
Obor Genetika a molekulární biologie
Klíčová slova comparative genomics; Treponema pallidum
Popis As a result of DNA microarray comparisons, 25 genes (13 with stronger and 6 with weaker signal in pertenue strains and 6 control genes with similar signal in both subspecies examined) were selected and sequenced. Altogether, 24083 nucleotides (2.12% of the genome) were sequenced in 3 pertenue strains and control Nichols. No region of extensive sequence heterogeneity was detected. However, 15 different single nucleotide polymorfisms (SNP) were identified: 3 SNPs in Gauthier strain, 14 in Samoan D and 15 SNPs in CDC-2. Ten (out of 15) SNPs cause amino acid changes. SNPs common for all pertenue strains as well as SNPs specific for each individual strain will allow to use these nucleotide polymorfisms to design sequence specific PCR diagnostics of these strains.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.