Hybridní molekuly kolicinů U/Y a jejich interakce s imunitním proteinem

Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Ekonomicko-správní fakultu, ale pod Lékařskou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

JANALÍKOVÁ Magda ŠMAJS David

Rok publikování 2003
Druh Článek ve sborníku
Konference Abstrakta 47. Studentské vědecké konference
Fakulta / Pracoviště MU

Lékařská fakulta

Citace
Obor Genetika a molekulární biologie
Klíčová slova colicin; immunity protein
Popis V nedávné době byly popsány a molekulárně charakterizovány dva nové koliciny U a Y. Plazmid pColU, který byl identifikován v bakterii Shigella boydii, nese skupinu genů zahrnující gen pro kolicin U, gen pro imunitní protein a gen pro lytický protein. Plazmid pCol-Let, který byl izolován z bakterie E. coli, nese podobnou skupinu genů pro kolicin Y a geny pro imunitní a lytické proteiny. Příbuznost těchto kolicinů je založena na sekvenční podobnosti kolicinů, imunitních proteinů a proteinů lytických. Přes sekvenční podobnost kolicinů U a Y, nejsou producenti obou kolicinů zkříženě imunní. Jednou z možností studia interakce kolicinu s imunitním proteinem je zkoumání letálního účinku hybridních či mutovaných kolicinů (jejichž producenti nejsou zkříženě imunní) na buňky transformované plazmidem nesoucím imunitní protein. Zkonstruovali jsme pět hybridních proteinů kolicinu U/Y a zjistili jsme, že aminokyselinové zbytky kolicinů U a Y, důležité pro interakci s jejich imunitními proteiny, jsou rozdílné. Pro interakci kolicinu U s jeho imunitním proteinem je klíčový aminokyselinový zbytek G580. Navíc v rekognici imunitního proteinu U kolicinem U hraje významnou roli aminokyselinový zbytek F576. Třetí interakční místo je distálně od Spe I místa (34 aminokyselin od C-konce z nichž je u kolicinu U a Y 12 rozdílných). Oproti tomu u kolicinu Y jsou pro tutéž interakci významné aminokyselinové zbytky V590 a Y586. Menší význam pro interakci kolicinu Y s imunitním proteinem má také aminokyselinový zbytek A594 a/nebo A595. I zde se předpokládá vliv interakčního místa v C-terminálních 34 aminokyselinách. Navíc jsou připravovány hybridní molekuly imunitních proteinů U/Y, které budou použity pro studium oblastí imunitních proteinů interagujících s koliciny U a Y.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.