Interaction of colicins U and Y with recombinant immunity proteins
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2004 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků. |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Mikrobiologie, virologie |
| Klíčová slova | colicin; immunity protein |
| Popis | Pro identifikaci aminokyselinových zbytků imunitního proteinu kolicinu U a Y interagujících s kolicinem U a Y byly použity dvě základní techniky. První z nich spočívala v konstrukci hybridních proteinů mezi imunitními proteiny kolicinů U a Y a druhý přístup spočíval v cílené mutagenezi genu pro imunitní protein kolicinu U tak, aby změny v aminokyselinové sekvenci odpovídaly sekvenci imunitního proteinu kolicinu Y. Bylo připraveno 16 odlišných hybridních genů pro imunitní protein a 29 konstruktů zahrnujících záměnu 44 odlišných aminokyselinových zbytků (z celkového počtu 54 odlišných). U těchto konstruktů byla testována imunita ke kolicinům U, Y, A, B a N. Imunitní protein kolicinu U je zcela specifický pro kolicin U a nepřináší imunitu proti žádnému jinému testovanému kolicinu. Oproti tomu imunitní protein kolicinu Y přináší jak specifickou imunitu proti kolicinu Y (i když ne tak výraznou jako imunitní protein kolicinu U ke kolicinu U), tak částečnou imunitu ke kolicinu U a A (nikoliv však k sekvenčně příbuzným kolicinům B a N). Aminokyseliny významné pro imunitu ke kolicinu U jsou lokalizovány mezi zbytky 13 - 19 imunitního proteinu. Tyto aminokyseliny jsou lokalizovány v 1. transmembránovém úseku imunitního proteinu. Další interakční místo se předpokládá ve druhém a čtvrtém transmembránovém úseku. U imunitního proteinu kolicinu Y je pravděpodobné, že interakční místo s kolicinem Y tvoří aminokyselinové zbytky druhého a čtvrtého transmembránového úseku, které navzájem spolupracují a kódují imunitu ke kolicinu Y jen tehdy, jsou-li přítomny současně. |
| Související projekty: |