Complexity and Convergence of Electrostatic and van der Waals Energies within PME and Cutoff Methods

Varování

Publikace nespadá pod Ekonomicko-správní fakultu, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Složitost a konvergence výpočtu energie elektrostatických a van der Waalsovských interakcí prostřednictvím PME a cutoff metod
Autoři	SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka KOČA Jaroslav ZHAN Chang-Guo
Rok publikování	2004
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	International Journal of Molecular Sciences
Fakulta / Pracoviště MU	Fakulta informatiky
Citace
www	http://www.mdpi.org/ijms/papers/i5040154.pdf
Obor	Fyzikální chemie a teoretická chemie
Klíčová slova	Van der Waals energy; electrostatic energy; convergence of energy; PME
Popis	V článku byla studována výpočetní složitost a konvergence PME a cutoff metod, sloužících pro výpočet energie elektrostatických a van der Waalsovských interakcí. Z výsledků analýz jsme učinili následující závěry: Volba vhodné metody záleží na typu molekuly. Pro nukleové kyseliny byla vhodnější metoda PME, pro proteiny cutoff metody, v případě oligosacharidů je možno použít obě metody.
Související projekty:	Strukturně-funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu