A Novel Mechanism of Proton Transfer in Protonated Peptides

Varování

Publikace nespadá pod Ekonomicko-správní fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	KULHÁNEK Petr SCHLAG Edward W. KOČA Jaroslav
Rok publikování	2003
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Journal of the American Chemical Society
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
www	http://dx.doi.org/10.1021/ja035800z
Obor	Fyzikální chemie a teoretická chemie
Klíčová slova	proton transfer; proton exchange; proton interaction; DFT
Popis	The study presents quantum-chemical calculations on proton transfer in protonated N-acetylglycyl-N1-methylglycinamide (AGA) as a short oligopeptide model. All calculations employ the B3LYP functional and the 6-31++G** basis set. Two different mechanisms of proton transfer are discussed. The rate-determining step of the first mechanism exhibits an energy barrier of about 17.7 kcal/mol, and it is represented by an isomerization of the proton around the double bond of the carbonyl group. The second mechanism is based on the large conformational flexibility of AGA, where all carbonyl oxygens cooperate. The rate-determining step of this mechanism exhibits an energy barrier of only 8.3 kcal/mol.
Související projekty:	Biomolekulární centrum