Variabilita DNA v okruhu Poa pratensis v České republice
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2002 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | IXth Congress of the Czech Botanical Society / IX. Sjezd České botanické společnosti: Abstracts |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Botanika |
| Klíčová slova | Flow cytometry; cpDNA; restriction analysis; trnL-trnF |
| Popis | Analýza množství jaderné DNA průtokovou cytometrií a nekódující chloroplastové DNA pomocí restrikční analýzy potvrdila variabilitu DNA v okruhu Poa pratensis v rámci České republiky. Množství celkové jaderné DNA bylo určeno pro padesát dvě rostliny ze sedmnácti lokalit z České republiky, převážně z Moravy. Největší množství DNA obsahovalo sedm vzorků rostlin z okolí Chrudimi. Pomocí standartu (rostlina o známém váhovém množství DNA a zároveň s přesně určeným množstvím chromozomů) bylo množství jaderné DNA přepočteno na množství chromozomů a tímto byl jejich počet stanoven na šedesát osm až osmdesát jeden chromosom. Stejným postupem byl počet chromosomů určen u dalších vzorků. Čtrnáct rostlin z okolí Brna mělo podle výpočtů třicet jeden až padesát šest chromosomů. Dvě rostliny z Moravského krasu měly třicet dva chromosomy. Rostliny na jih od Brna měly všechny nízké množství jaderné DNA, které odpovídalo třiceti až čtyřiceti pěti chromosomům. Z toho lze usuzovat na možnost, že v Panonii mají zástupci okruhu Poa pratensis menší obsah jaderné DNA než v jiných oblastech. Pro další posouzení variability Poa pratensis bylo použito úseku chloroplastové DNA, kterým byla nekódující sekvence trnL intronu a trnL-trnF intergenového spaceru. Provedli jsme restrikční analýzu s použitím endonukleáz Alu I, BsaJ I a Bsm I. Jako vzor byly použity tři odrůdy, pocházející ze Šlechtitelské stanice Hladké Životice. U nich byly nalezeny tři typy této sekvence, které byly označeny písmeny MM, MS a HM. Ve sto dvaceti vzorcích pocházejících z Evropy, Severní Ameriky a Asie byly pak tyto tři typy nalezeny také plus jeden další, který se u vzorových kultivarů nevyskytoval. Celkový počet analyzovaných rostlin z České republiky byl dvacet tři, z toho sekvenci chloroplastové DNA typu MS měly rostliny z okolí Brna, jedna z okolí Chrudimi, dvě z jižních Čech, dále pak z Moravského krasu a z jižní Moravy. Sekvenci DNA typu MM měla jedna rostlina z Ostopovic u Brna a jedna z okolí Chrudimi. Konečně sekvenci DNA typu HM měla pouze jedna rostlina a to z Ivančic u Brna. Je zajímavé, že na tak poměrně malém území byly nalezeny téměř všechny typy, jako na různých místech severní polokoule. Nebyla nalezena souvislost mezi typem sekvence chloroplastové DNA a určeným množstvím jaderné DNA u dané rostliny. |
| Související projekty: |