PDBImages: a command-line tool for automated macromolecular structure visualization

Varování

Publikace nespadá pod Ekonomicko-správní fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

MIDLIK Adam NAIR Sreenath ANYANGO Stephen DESHPANDE Mandar SEHNAL David VARADI Mihaly VELANKAR Sameer

Rok publikování 2023
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj Bioinformatics
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
www https://academic.oup.com/bioinformatics/article/39/12/btad744/7470737
Doi http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btad744
Klíčová slova biomacromolecules; organelle- and cell-sized models; PDBImages; open-source; visualization; databases; software; 3D structure; bioinformatics
Popis PDBImages is an innovative, open-source Node.js package that harnesses the power of the popular macromolecule structure visualization software Mol*. Designed for use by the scientific community, PDBImages provides a means to generate high-quality images for PDB and AlphaFold DB models. Its unique ability to render and save images directly to files in a browserless mode sets it apart, offering users a streamlined, automated process for macromolecular structure visualization. Here, we detail the implementation of PDBImages, enumerating its diverse image types, and elaborating on its user-friendly setup. This powerful tool opens a new gateway for researchers to visualize, analyse, and share their work, fostering a deeper understanding of bioinformatics.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.