Integration of Cryo-EM Model Building Software in Scipion

Varování

Publikace nespadá pod Ekonomicko-správní fakultu, ale pod Ústav výpočetní techniky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	MARTÍNEZ Marta JIMÉNEZ-MORENO Amaya MALUENDA David RAMÍREZ-APORTELA Erney MELERO Roberto CUERVO Ana CONESA Pablo DEL CANO Laura FONSECA Yunior SÁNCHEZ-GARCÍA Ruben STŘELÁK David CONESA Javier FERNÁNDEZ-GIMÉNEZ Estrella DE ISIDRO Federico SORZANO Carlos CARAZO Jose Maria MARABINI Roberto
Rok publikování	2020
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Journal of Chemical Information and Modeling
Fakulta / Pracoviště MU	Ústav výpočetní techniky
Citace
www	http://dx.doi.org/10.1021/acs.jcim.9b01032
Doi	http://dx.doi.org/10.1021/acs.jcim.9b01032
Klíčová slova	ELECTRON-MICROSCOPY; LOCAL RESOLUTION; VALIDATION TOOLS; VISUALIZATION; MAPS
Popis	Advances in cryo-electron microscopy (cryo-EM) have made it possible to obtain structures of large biological macromolecules at near-atomic resolution. This "resolution revolution" has encouraged the use and development of modeling tools able to produce high-quality atomic models from cryo-EM density maps. Unfortunately, many practical problems appear when combining different packages in the same processing workflow, which make difficult the use of these tools by non-experts and, therefore, reduce their utility. We present here a major extension of the image processing framework Scipion that provides inter-package integration in the model building area and full tracking of the complete workflow, from image processing to structure validation.
Související projekty:	Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace IX Zapojení studentů Fakulty informatiky do mezinárodní vědecké komunity 20