Influence of Trp flipping on carbohydrate binding in lectins. An example on Aleuria aurantia lectin AAL

Varování

Publikace nespadá pod Ekonomicko-správní fakultu, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	HOUSER Josef KOZMON Stanislav MISHRA Deepti MISHRA Sushil Kumar ROMANO Patrick R WIMMEROVÁ Michaela KOČA Jaroslav
Rok publikování	2017
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Plos one
Fakulta / Pracoviště MU	Středoevropský technologický institut
Citace
www	http://journals.plos.org/plosone/article/file?id=10.1371/journal.pone.0189375&type=printable
Doi	http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0189375
Obor	Biochemie
Klíčová slova	FUCOSE-SPECIFIC LECTIN; DISPERSION INTERACTIONS; CRYSTAL-STRUCTURE; PI INTERACTION; CORE FUCOSE; PROTEIN; APPROXIMATION; ENERGY; RECOGNITION; SPECIFICITY
Popis	Interakce protein-cukr jsou často zprostředkovány pomocí CH-pi interakce zahrnující boční řetězec aromatické aminokyseliny. Analýza PDB databáze prokázala tuto interakci pro 265 ligandů a 5208 motivů. Modelový systém interakce je lektinová rodina AAL. V této studii jsme pomocí RTG struktury s vysokým rozlišením a následné in silico analýze prokázali existenci dvou preferovaných konformerů Trp a porovnali jejich výskyt a energetickou bilanci pro vazbu sacharidu.
Související projekty:	Studium proteinu z patogenu zapojených do rozpoznávání hostitelského organismu CERIT Scientific Cloud CEITEC 2020