CAVER Analyst 1.0: Graphic tool for interactive visualization and analysis of tunnels and channels in protein structures

Varování

Publikace nespadá pod Ekonomicko-správní fakultu, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	CAVER Analyst 1.0: Grafický nástroj pro interaktivní vizualizaci a analýzu tunelů a kanálů v proteinech
Autoři	KOZLÍKOVÁ Barbora ŠEBESTOVÁ Eva ŠUSTR Vilém BREZOVSKÝ Jan STRNAD Ondřej DANIEL Lukáš BEDNÁŘ David PAVELKA Antonín MANAK Martin BEZDĚKA Martin BENEŠ Petr KOTRY Matúš GORA Artur Wiktor DAMBORSKÝ Jiří SOCHOR Jiří
Rok publikování	2014
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Bioinformatics
Fakulta / Pracoviště MU	Fakulta informatiky
Citace
Doi	http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btu364
Obor	Informatika
Klíčová slova	protein; visualization; tunnel; cavity
Popis	The transport of ligands, ions or solvent molecules into proteins with buried binding sites or through the membrane is enabled by protein tunnels and channels. CAVER Analyst is a software tool for calculation, analysis and real-time visualization of access tunnels and channels in static and dynamic protein structures. It provides an intuitive graphic user interface for setting up the calculation and interactive exploration of identified tunnels/channels and their characteristics.
Související projekty:	CPG - Centrum počítačové grafiky Analýza a vizualizace proteinových struktur Výzkum FI ve vybraných oblastech aplikované informatiky