PredictSNP 1.0

Varování

Publikace nespadá pod Ekonomicko-správní fakultu, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

BENDL Jaroslav ŠTOURAČ Jan SALANDA O. PAVELKA Antonín WIEBEN E.D. ZENDULKA J. BREZOVSKÝ Jan DAMBORSKÝ Jiří

Rok publikování 2013
Druh Software
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

www http://loschmidt.chemi.muni.cz/predictsnp/
Popis Tento nástroj předpovídá efekt aminokyselinových substitucí na funkci proteinů. Jeho predikce jsou založeny na kombinaci výsledků existujících metod (MAPP, PhD-SNP, PolyPhen-1, PolyPhen-2, SIFT a SNAP), přičemž tyto metody v objektivních testech významně překonává. Metodika tvorby konsenzu je popsaná v článku: "Bendl et. al. (2014) PredictSNP: Robust and Accurate Consensus Classifier for Prediction of Disease-Related Mutations. PLoS Computational Biology, 10". Uživatelské rozhraní bástroje ukazuje nejen výsledky integrovaných nástrojů a vyvinutého meta-klasifikátoru, ale také nalezené experimentální anotace těchto mutací z databází PMD a UniProt. Nástroj je zdarma dostupný akademické komunitě na adrese http://loschmidt.chemi.muni.cz/predictsnp.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.