R/Bioconductor package for identification of triplex-forming sequences

Varování

Publikace nespadá pod Ekonomicko-správní fakultu, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Název česky Balíček pro R/Bioconductor pro identifikaci sekvencí tvořících triplex
Autoři

HON Jiří LEXA Matej MARTÍNEK Tomáš RAJDL Kamil

Rok publikování 2013
Druh Software
Fakulta / Pracoviště MU

Fakulta informatiky

www http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/triplex.html
Popis This package provides functions for identification and visualization of potential intramolecular triplex patterns in DNA sequence. The main functionality is to detect the positions of subsequences capable of folding into an intramolecular triplex (H-DNA) in a much larger sequence. The potential H-DNA (triplexes) should be made of as many cannonical nucleotide triplets as possible. The package includes visualization showing the exact base-pairing in 1D, 2D or 3D.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.