Molecular dynamics simulations of G-DNA and perspectives on the simulation of nucleic acid structures

Logo poskytovatele

Varování

Publikace nespadá pod Ekonomicko-správní fakultu, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.
Autoři

ŠPONER Jiří CANG Xiaohui CHEATHAM Thomas E

Rok publikování 2012
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj Methods
Fakulta / Pracoviště MU

Středoevropský technologický institut

Citace
www http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1046202312000941
Doi http://dx.doi.org/10.1016/j.ymeth.2012.04.005
Obor Biofyzika
Klíčová slova Molecular dynamics simulations; Guanine quadruplex; DNA ligand binding; Force field limitations; Force field development
Přiložené soubory
Popis The article reviews the application of biomolecular simulation methods to understand the structure, dynamics and interactions of nucleic acids with a focus on explicit solvent molecular dynamics simulations of guanine quadruplex (G-DNA and G-RNA) molecules. While primarily dealing with these exciting and highly relevant four-stranded systems, where recent and past simulations have provided several interesting results and novel insight into G-DNA structure, the review provides some general perspectives on the applicability of the simulation techniques to nucleic acids. (C) 2012 Elsevier Inc. All rights reserved.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.