Toward reading the sequence of short oligonucleotides from their retention factors obtained by means of hydrophilic interaction chromatography and ion-interaction reversed-phase liquid chromatography
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2012 |
| Druh | Článek v odborném periodiku |
| Časopis / Zdroj | Journal of Separation Science |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| www | http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jssc.201200482/abstract |
| Doi | http://dx.doi.org/10.1002/jssc.201200482 |
| Obor | Analytická chemie, separace |
| Klíčová slova | Hydrophilic interaction chromatography; Ion-interaction reversed-phase liquid chromatography; Oligonucleotide sequencing; Penta-nucleotide; Retention behavior |
| Přiložené soubory | |
| Popis | Pomocí hydrofilní interakční chromatografie a iontově-interakční chromatografie na reverzní fázi byly sledovány retenční charakteristiky vybraných syntetických 5-penta nukleotidů, s chybějícím koncovým fosfátem na tomto konci, obsahující adenin, guanin a thymin, vzhledem k jejich sekvenci. Našli jsme jednoduchý lineární aditivní model, který popisuje retenční pořadí v obou separačních módech z hlediska jejich sekvence. Naše výsledky ukazují, že penta-nukleotidová sekvence, a tím i jeho prostorové uspořádání vyvolané okolním prostředím, velmi souvisí s retenčními vlastnostmi, a proto mohou být hypoteticky použity k čtení sekvence z retenčních vlastností získaných podle konkrétních separačních podmínek. |
| Související projekty: |