Informace o projektu
Česká národní infrastruktura pro biologická data
(ELIXIR-CZ)
- Kód projektu
- LM2015047
- Období řešení
- 1/2016 - 12/2019
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Velké infrastruktury pro výzkum, vývoj a inovace
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Středoevropský technologický institut
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
- RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
- Mgr. Martin Prokop, Ph.D.
- RNDr. Tomáš Raček, Ph.D.
- RNDr. David Sehnal, Ph.D.
- doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D.
- prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
- Další fakulta/pracoviště MU
-
Ústav výpočetní techniky
- prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc.
- Mgr. Ivana Křenková
- Mgr. Slávek Licehammer
- RNDr. Michal Procházka, Ph.D.
- Mgr. Zdeněk Salvet
- WWW stránky projektu
- https://www.elixir-czech.cz/
- Spolupracující organizace
-
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba RNDr. Jiří Vondrášek, CSc.
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Univerzita Karlova
Univerzita Palackého v Olomouci
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze
Fakultní nemocnice U sv. Anny Brno
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Biotechnologický ústav AV ČR, v.v.i.
It is a current global trend that life science experiments generate an immense and steadily increasing volume of data. The Czech Republic feels this trend very strongly, because several new life science infrastructures were successfully established here, and they produce large amounts of data. It is necessary to store the data, safely manipulate with them, efficiently extract key information, etc. ELIXIR CZ is an infrastructure which is prepared to accept this challenge.
Thus, ELIXIR CZ aims to create a sustainable infrastructure for storing, processing and analysis of life science data in the Czech Republic. It will also provide tools and training that will facilitate performing these activities. Currently, ELIXIR CZ involves eleven institutions - nine life science research centres and two IT infrastructures. ELIXIR CZ also creates a communication platform for life science research institutes in the Czech Republic. ELIXIR CZ is a node of the European ESFRI project ELIXIR and is strongly involved in its activities. The ELIXIR project was approved by the Competitiveness Council from ESFRI as one of three prioritised Research Infrastructures.
Publikace
Počet publikací: 68
2019
-
Computational Design of Stable and Soluble Biocatalysts
ACS Catalysis, rok: 2019, ročník: 9, vydání: 2, DOI
-
Computational Modelling of Metabolic Burden and Substrate Toxicity in Escherichia coli Carrying a Synthetic Metabolic Pathway
Microorganisms, rok: 2019, ročník: 7, vydání: 11, DOI
-
Computational Study of Protein-Ligand Unbinding for Enzyme Engineering
FRONTIERS IN CHEMISTRY, rok: 2019, ročník: 6, vydání: JAN 2019, DOI
-
Deciphering the Structural Basis of High Thermostability of Dehalogenase from Psychrophilic Bacterium Marinobacter sp. ELB17
Microorganisms, rok: 2019, ročník: 7, vydání: 11, DOI
-
Engineering enzyme access tunnels
BIOTECHNOLOGY ADVANCES, rok: 2019, ročník: 37, vydání: 6, DOI
-
Exploring the challenges of computational enzyme design by rebuilding the active site of a dehalogenase
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, rok: 2019, ročník: 116, vydání: 2, DOI
-
Fast Screening of Inhibitor Binding/Unbinding using Novel Software Tool CaverDock
FRONTIERS IN CHEMISTRY, rok: 2019, ročník: 7, vydání: OCT 29 2019, DOI
-
NMDA Receptor Opening and Closing-Transitions of a Molecular Machine Revealed by Molecular Dynamics
Biomolecules, rok: 2019, ročník: 9, vydání: 10, DOI
-
Rapidly Display Glycan Symbols in 3D Structures: 3D-SNFG in LiteMol
Journal of Proteome Research, rok: 2019, ročník: 18, vydání: 2, DOI
-
Structural Biology and Protein Engineering of Thrombolytics
Computational and Structural Biology Journal, rok: 2019, ročník: 17, vydání: 2019, DOI