Informace o projektu
Biomolekulární centrum
- Kód projektu
- LC06030
- Období řešení
- 3/2006 - 12/2011
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Centra základního výzkumu
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Středoevropský technologický institut
- prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc.
- Klíčová slova
- léčiva proti rakovině, biosenzory, lektiny, počítačové modelování biomolekul, biomolekulární NMR
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
- Odpovědná osoba doc. RNDr. Ivan Rychlík, Ph.D.
Klíčovým motivem projektu je posunout strukturní biologii v ČR z úrovně studia jednotlivých biomakromolekul na úroveň studia jejich komplexů. To bude uskutečněno jednak implementací nejmodernějších trendů ve vybraných metodách v této oblasti (NMR spektroskopie, počítačové modelování), jednak orientací na problémy, které stojí v popředí zájmu současných věd o živých systémech. K nim patří studium klíčových buněčných procesů jako je udržení stability genomu a oprava DNA, syntéza bílkovin v ribosomu či přenos informace prostřednictvím rozpoznávání (lektiny). Vybrané směry výzkumu budou dovedeny do bioanalytických (biosensory) či biomedicinálních (vakcíny, chemoterapeutika) závěrů vhodných jako východiska pro aplikovaný výzkum a vývoj. Dosažení cíle projektu není možné pouze v jediné ze zakládajících organizací Centra, je třeba spolupráce všech partnerů. U řady jednotlivých dílčích cílů bude vyžadována i spolupráce zahraniční.
Výsledky
Klíčovým motivem projektu je posunout strukturní biologii v ČR z úrovně studia jednotlivých biomakromolekul na úroveň studia jejich komplexů. To bude uskutečněno jednak implementací nejmodernějších trendů ve vybraných metodách v této oblasti (NMR spektroskopie, počítačové modelování), jednak orientací na problémy, které stojí v popředí zájmu současných věd o živých systémech. K nim patří studium klíčových buněčných procesů jako je udržení stability genomu a oprava DNA, syntéza bílkovin v ribosomu či přenos informace prostřednictvím rozpoznávání (lektiny). Vybrané směry výzkumu budou dovedeny do bioanalytických (biosensory) či biomedicinálních (vakcíny, chemoterapeutika) závěrů vhodných jako východiska pro aplikovaný výzkum a vývoj. Dosažení cíle projektu není možné pouze v jediné ze zakládajících organizací Centra, je třeba spolupráce všech partnerů. U řady jednotlivých dílčích cílů bude vyžadována i spolupráce zahraniční.
Publikace
Počet publikací: 284
2010
-
Novel lectins from Aspergillus fumigatus
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
Phosphorus Chemical Shifts in a Nucleic Acid Backbone from Combined Molecular Dynamics and Density Functional Calculations
The Journal of the American Chemical Society, rok: 2010, ročník: 132, vydání: 48
-
Proteiny Aspergillus fumigatus zapojené do interakce s hostitelem
Chemické listy, rok: 2010, ročník: 104, vydání: 5
-
Rad52 SUMOylation affects the efficiency of the DNA repair
Nucleic Acids Research, rok: 2010, ročník: 38, vydání: 6
-
Reaction Mechanism of MutH Enzyme: Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Study
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
Recognition of selected monosaccharides by Pseudomonas aeruginosa Lectin II analyzed by molecular dynamics and free energy calculations
Carbohydrate Research, rok: 2010, ročník: 345, vydání: 10
-
S3EPY: a Sparky extension for determination of small scalar couplings from spin-state-selective excitation NMR experiments
Journal of Biomolecular NMR, rok: 2010, ročník: 46, vydání: 2
-
Solution structure of the N-terminal domain of Bacillus subtilis delta subunit of RNA polymerase and its classification based on structural homologs
Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, rok: 2010, ročník: 78, vydání: 7
-
Srs2: the Odd-Job Man in DNA repair
DNA Repair, rok: 2010, ročník: 9, vydání: 3
-
Strategy for complete NMR assignment of disordered proteins with highly repetitive sequences based on resolution-enhanced 5D experiments
Journal of Biomolecular NMR, rok: 2010, ročník: 48, vydání: 3