Informace o projektu
Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů

Informace

Projekt nespadá pod Ekonomicko-správní fakultu, ale pod Lékařskou fakultu. Oficiální stránka projektu je na webu muni.cz.

Kód projektu

NR8967

Období řešení

1/2006 - 12/2009

Investor / Programový rámec / typ projektu

Ministerstvo zdravotnictví ČR

Resortní program výzkumu a vývoje - MZ

Fakulta / Pracoviště MU

Lékařská fakulta

Klíčová slova

Treponema pallidum, srovnávací genomika, PCR diagnostika, nukleotidové polymorfismy

Spolupracující organizace

Fakultní nemocnice U sv. Anny Brno

Odpovědná osoba doc. MUDr. Vladana Woznicová, Ph.D.
Odpovědná osoba Mgr. Monika Dvořáková Heroldová, Ph.D.
Odpovědná osoba prof. MUDr. Miroslav Votava, CSc.
Odpovědná osoba MUDr. Jana Račovská

Projekt předpokládá vyšetření desítek až set kmenů a izolátů pddruhu T. pallidum ssp. apllidum v hypervariabilních oblastech genomu. Rozdíly v těchto sekvencích budou použity pro identifikaci individuálních kmenů tohoto poddruhu.
Rozdíly v genomech kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum budou zjišťovány po PCR amplifikaci sekvenací PCR produktů. Bude navržen zjednodušený protokol na identifikaci nejčastějších kmenů na základě PCR aplifikace a RFLP.

Publikace

Počet publikací: 90

2009

The complete genome sequence of T. paraluiscuniculi strain Cuniculi A and its comparison with syphilis spirochete genome.

ŠMAJS David STROUHAL Michal ZOBANÍKOVÁ Marie ČEJKOVÁ Darina POSPÍŠILOVÁ MATĚJKOVÁ Petra WEINSTOCK George M.

Konferenční abstrakty

Rok: 2009, druh: Konferenční abstrakty
Whole genome amplification and analysis: genome differences in the genus Treponema.

MIKALOVÁ Lenka STROUHAL Michal MATĚJKOVÁ POSPÍŠILOVÁ Petra ŠMAJS David WEINSTOCK George M.

Konferenční abstrakty

Rok: 2009, druh: Konferenční abstrakty
Whole genome sequencing of pathogenic and nonpathogenic treponemes: comparison of syphilis and yaws strains with T. paraluiscuniculi.

ŠMAJS David ZOBANÍKOVÁ Marie ČEJKOVÁ Darina MATĚJKOVÁ POSPÍŠILOVÁ Petra STROUHAL Michal GEORGE M. Weinstock

Článek ve sborníku

Clinical Microbiology and Infection, Volume 15, Issue s4, Abstracts of the 19th ECCMID, P1329, rok: 2009

2008

A novel Treponema pallidum antigen, TP0136, is an outer membrane protein that binds human fibronectin.

BRINKMAN Mary Beth MCGILL Melanie A. PETTERSSON Jonas ROGERS Arthur MATĚJKOVÁ Petra ŠMAJS David WEINSTOCK George M. NORRIS Steven J. PALZKILL Timothy

Článek v odborném periodiku

INFECTION AND IMMUNITY, rok: 2008, ročník: 76, vydání: 5
Celogenomové sekvenační metody: srovnání 3 metod při sekvenaci genomu Treponema pallidum subspecies pertenue Samoa D.

ZOBANÍKOVÁ Marie MATĚJKOVÁ Petra STROUHAL Michal ČEJKOVÁ Darina ŠMAJS David

Konferenční abstrakty

Rok: 2008, druh: Konferenční abstrakty
Complete genome sequence of Treponema pallidum ssp. pallidum strain SS14 determined with oligonucleotide arrays

MATĚJKOVÁ Petra STROUHAL Michal ŠMAJS David NORRIS Steven J. PALZKILL Timothy PETROSINO Joseph F. SODERGREN Erica NORTON Jason E. SINGH Jaz RICHMOND Todd A. MOLLA Michael N. ALBERT Thomas J. WEINSTOCK George M.

Článek v odborném periodiku

BMC Microbiology, rok: 2008, ročník: 8, vydání: 8
Diagnostika časné syfilidy metodou PCR, přínos pro klinickou praxi.

VALIŠOVÁ Zuzana WOZNICOVÁ Vladana FLASAROVÁ Magdalena MATĚJKOVÁ POSPÍŠILOVÁ Petra ŠMAJS David

Konferenční abstrakty

Rok: 2008, druh: Konferenční abstrakty
Genome differences in the genus Treponema.

MIKALOVÁ Lenka STROUHAL Michal MATĚJKOVÁ Petra ŠMAJS David

Článek ve sborníku

XIX. Biologické dny, sborník abstrakt., rok: 2008
Mapování sekvenčních rozdílů opičího izolátu Treponema pallidum Fribourg-Blanc a lidských patogenních spirochet.

MIKALOVÁ Lenka AMBROŽOVÁ Lenka ŠMAJS David

Konferenční abstrakty

Rok: 2008, druh: Konferenční abstrakty
PCR detekce a kmenová typizace spirochety Treponema pallidum v biologickém materiálu.

FLASAROVÁ Magdalena ŠMAJS David

Konferenční abstrakty

Rok: 2008, druh: Konferenční abstrakty