Identifikace genetických rozdílů mezi původci yaws a syfilis.
| Authors | |
|---|---|
| Year of publication | 2010 |
| Type | Conference abstract |
| MU Faculty or unit | |
| Citation | |
| Description | Rod Treponema zahrnuje několik druhů a poddruhů patogenních spirochet. Treponema pallidum subsp. pallidum (TPA) je obligátním patogenem člověka a způsobuje pohlavně přenosnou systémovou infekci s celosvětovým výskytem, označovanou jako syfilis. Mezi klinicky významné poddruhy patří i původce nevenerického onemocnění yaws Treponema pallidum subsp. pertenue (TPE), s charakteristickým výskytem v tropických oblastech. Lze předpokládat, že různá míra invazivity a patogenity těchto spirochet je způsobena rozdíly v jejich genomech. Pro celogenomové restrikční mapování (WGF) byly použity 3 kmeny poddruhu T. p. pallidum (DAL-1, SS14 a Mexico A), 3 kmeny poddruhu T. p. pertenue (Gauthier, CDC-2 a Samoa D) a dosud taxonomicky nezařazený kmen T. pallidum Fribourg-Blanc izolovaný z paviána. Genomy všech studovaných kmenů byly rozděleny na základě referenční sekvence kmene T. pallidum subsp. pallidum Nichols do 133 překrývajících se intervalů (TPI intervalů. TPI intervaly byly štěpeny restrikčními endonukleázami. I přes vysokou sekvenční shodu jednotlivých poddruhů pallidum a pertenue, lze tyto poddruhy odlišit na základě 6 genomových oblastí, kde se nachází sekvenční změny ve formě indelů v rozmezí velikostí 38 – 635 bp. Detekovaných změn lze využít v molekulární diagnostice onemocnění yaws a syfilis, především v oblastech, kde se obě tato onemocnění vyskytují současně. Sérologická neodlišitelnost treponemálních původců yaws a syfilis totiž výrazně komplikuje klinickou diagnostiku těchto onemocnění. |
| Related projects: |