Project information
Modern techniques of nuclear magnetic resonance and their applications to study structure and dynamics of biologically relevant macromolecules
- Project Identification
- GA203/96/1513
- Project Period
- 1/1996 - 1/1998
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Science
- prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc.
Nukleární magnetická resonance patři k nejrychleji se rozvíjejícím spektroskopickým metodám. Vývoj nových experimentálních technik je určován především potřebami spektroskopie při vysokých polích, která umožňuje detailní studium prostorové struktury biomakromolekul. Předkládaný projekt je orientován na vývoj nových experimentálních technik vicedimenzionální NMR spektroskopie a metodických postupů analýzy získaných dat. Při řešení se bude vycházet z dosavadních zkušeností řešitelů v této vědní oblasti. Experimentální práce budou zaměřeny na vývoj nových metod vícenásobných rezonancí pro studium struktury a dynamiky RNA oligonukleotidů značených izotopy 13C a 15N, pulzních technik gradientní NMR spektroskopie využívající gradientů x,y,z a na studium struktury modelových tRNA oligonukleotidů. V teoretické oblasti bude hlavní pozornost věnována metodice ab initio výpočtů chemických posunů jader 13C, 15N a 31P v nukleových kyselinách a vývoji netradičních způsobů výpočtu prostorové struktury biomakromolekul.
Publications
Total number of publications: 19
2003
-
The effect of water on NMR spin-spin couplings in DNA: Improvement of calculated values by application of two solvent models
Physical Chemistry Chemical Physics, year: 2003, volume: 5, edition: 4
2000
-
Ab Initio Calculations of of Spin - Spin Coupling Constants in Anhydrodeoxythymidines
Journal of Physical Chemistry A, year: 2000, volume: 104, edition: 12
-
Ab initio výpočty chemických posunů v biomolekulách
Chemické listy, year: 2000, volume: 94, edition: 2
1999
-
15N NMR study of isoquinoline alkaloids
Magnetic Resonance in Chemistry, year: 1999, volume: 37, edition: 3
-
1H and 13C NMR Study of Quaternary Benzo[c]phenanthridine Alkaloids
Magnetic Resonance in Chemistry, year: 1999, volume: 37, edition: 11
-
Ab Initio Calculations of 1H and 13C Chemical Shifts in Anhydrodeoxythymidines
Journal of Physical Chemistry A, year: 1999, volume: 103, edition: 20
-
Alkaloids and organics Acids Content of Eight Fumaria Species
Phytochemical Analysis, year: 1999, volume: 10, edition: 6
-
Differences in Conformational Behavior of ATA and TAT Sequences in Single Strand DNA Trimer
Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, year: 1999, volume: 16, edition: 5
-
HCCCH Experiments for Through-Bond Correlation of Thymine Resonances in C-13 Labeled DNA Oligonucleotides
Journal of Magnetic Resonance, year: 1999, volume: 137, edition: 2
1998
-
Sanguinarine Pseudobase: Re-examination of NMR Assignments Using Gradient-Enhanced Spectroscopy
Magnetic Resonance in Chemistry, year: 1998, volume: 36, edition: 11