Go to main content | Go to main menu | Go to search

Project information
Podjednotky urcující DNA specificitu bakteriální RNA polymerázy s flexibilními doménami: funkce a dynamika

Information

This project doesn't include Faculty of Economics and Administration. It includes Central European Institute of Technology. Official project website can be found on muni.cz.
Investor logo
Project Identification
GA13-16842S
Project Period
2/2013 - 12/2017
Investor / Pogramme / Project type
Czech Science Foundation
  • Standard Projects
MU Faculty or unit
Central European Institute of Technology
Cooperating Organization
Institute of Microbiology of the ASCR, v. v. i.
  • Responsible person Mgr. Libor Krásný, PhD.

V G+ bakteriích jsou delta a sigma podjednotky RNA polymerázy (RNAP) zásadními determinanty její specifity pro promotorovou DNA. Podjednotky delta i vegetativní sigmaA (SigA) obsahují domény, které se pohybují vuci zbytku molekuly. V soucasnosti jsme vyrešili 3D strukturu delty z Bacillus subtilis a identifikovali dve domény v tomto proteinu. Popsali jsme vliv delty na transkripci z vybraných promotoru a identifikovali jsme približnou polohu delty na RNAP, kde se váže v blízkosti SigA. Navrhujeme urcit vliv delty na celogenomové úrovni, urcit funkci jednotlivých domén delty a vytvorit strukturní model delty a SigA v komplexu s RNAP, který popíše i dynamiku jejich flexibilních cástí a charakterizuje jejich vzájemné interakce. Tyto experimenty nám umožní vytvorit komplexní model bunecné role proteinu delta. Výsledky projektu významne posunou naše porozumení transkripcní mašinerii z G+ bakterií, které zahrnují radu medicinálne a prumyslove významných druhu.

Publications

Total number of publications: 6

2017

2014

2013

You are running an old browser version. We recommend updating your browser to its latest version.