Charakterizace ETA-fágů indukovaných z klinických kmenů Staphylococcus aureus
| Title in English | Characterization of ETA-phages induced from clinical Staphylococcus aureus strains |
|---|---|
| Authors | |
| Year of publication | 2014 |
| Type | Article in Proceedings |
| Conference | Genetická konference GSGM 2014 |
| MU Faculty or unit | |
| Citation | |
| Web | http://www.biologicals.cz/conferences/index.php |
| Keywords | bacteriophage, exfoliative toxin A, lyzogenic conversion, Staphylococcus aureus |
| Description | Úvod: Kmeny Staphylococcus aureus produkující exfoliativní toxin A (ETA) a B (ETB) jsou hlavními původci kožních puchýřnatých onemocnění, postihujících zejména novorozence a děti předškolního věku. Gen kódující ETA je součástí fágového genomu integrovaného do bakteriálního chromozomu. Profágy spolu s plazmidy a jinými mobilními DNA elementy významně přispívají k plasticitě genotypových a fenotypových vlastností patogenní bakterie. Horizontálním přenosem genu eta prostřednictvím profága může dojít ke konverzi ETA-negativního kmene na producenta exfoliatinu. Cílem naší práce byla charakterizace genomu eta-gen-pozitivních fágů čeledi Siphoviridae, izolovaných z klinických kmenů S. aureus, které byly původci rozsáhlých epidermolytických infekcí ve dvou českých porodnicích. Metody: Z indukovaných fágů byla izolována DNA a podrobena restrikční analýze a PCR genotypizaci. DNA jedinečných fágů byla sekvenována metodou 454-sekvenování a analyzována bioinformatickými nástroji. Byla provedena lyzogenizace netoxinogenního kmene SAU1039, RPLA a PFGE analýza. Výsledky: Genotypizační metodou PCR bylo detekováno několik specifických genů a následné porovnání s již známými bakteriofágy S. aureus potvrdilo vysokou heterogenitu jejich genomů. Restrikční profily fágových genomů se navzájem lišily v několika unikátních fragmentech. Sekvenční analýzou celých genomů byla potvrzena jedinečnost obou dosud nepopsaných fágů. Byly identifikovány genomické oblasti vzniklé rekombinací s eta-negativními typy fágů. Lyzogenizace netoxinogenního kmene S. aureus indukovanými fágy a následné PCR, PFGE a RPLA analýzy potvrdily jejich schopnost horizontálního přenosu genu eta a fenotypové konverze. Závěr: V této práci byly izolovány a charakterizovány dva unikátní ETA-konvertující bakteriofágy. Jejich genom byl kompletně osekvenován, popsán a porovnán s genomy dosud osekvenovaných fágů S. aureus. Mezi fágovými genomy byla pozorována vysoká heterogenita, způsobená i vlivem zjištěné rekombinace. Mezi získané vlastnosti lyzogenních kmenů patřila především produkce ETA, která byla potvrzena metodou RPLA. Tato studie základního výzkumu fágů přispívá k hlubšímu poznání ETA-pozitivních kmenů S. aureus. Poděkování: Tato práce byla financována s pomocí Interní grantové agentury Ministerstva zdravotnictví (NT12395-5/2011) a specifického výzkumu MUNI/A/0843/2012. |
| Related projects: |